Sorprendentes tesoros a golpe de pala

Además de en la capilla, las sorpresas se han ido sucediendo durante la ejecución de la obra, como la aparición de tres huecos de iluminación en el ábside que se suman a los tres conocidos hasta la fecha, lo que convertía el altar mayor en un auténtico espectáculo de luz. El mayor desconcierto llegó al descubrirse una puerta de acceso al interior del templo desde el bajo coro «en arco de herradura perfecto, bellísimo, y con unas proporciones magníficas» que forma parte de la cultura islámica, así como dos capiteles de piedra en ménsula perfectamente conservados. El propio José Ramón Sola explica que «se está tratando de averiguar la razón cierta de su presencia en este edificio». También han aparecido una pequeña cripta y un sarcófago con restos momificados, y que había sido reutilizado, ya que encontraron huesos de otros posibles enterramientos. El Instituto Anatómico Forense de Valladolid analiza los restos, junto a los que había un sello del Papa Gregorio XIV, lo que indica «que se trataría de un enterramiento de una dignidad importante, puesto que además se situaba en el ábside de la iglesia».